Ежегодная Кавказская конференция является знаковым мероприятием, которое CI проводит с 2003 года. Она проходит в Ереване — центральном месте с легким доступом для участников и СМИ. Конференция является крупным событием, которое объединяет экспертов из региона и из-за рубежа для подведения итогов событий предыдущего года на Кавказе. В частности, докладчики анализируют политические, общественные и экономические тенденции в трех странах и де-факто государствах Южного Кавказа, а также на Северном Кавказе. Традиционно на конференции выступают докладчики из всех трех стран Южного Кавказа, а также гости из Европы, США, Великобритании, Турции и России, которые говорят о роли, которую сыграли в регионе ключевые внешние игроки в этом конкретном году. Это единственное мероприятие такого рода, проводимое в Армении или на Кавказе; его важность заключается в его регулярности, масштабе и высоком статусе местных и международных докладчиков и участников. В каждой конференции принимают участие более 150 человек, включая ученых, деятелей гражданского общества, государственных служащих, дипломатов, сотрудников международных организаций, журналистов и студентов. Материалы конференций
опубликованы в Caucasus Yearbooks. На протяжении более 20 лет проведение конференции стало возможным благодаря поддержке партнеров CI, включая посольство Великобритании в Армении,
Фонд Геберта Рюфа, Швейцария, посольство Швейцарии в Армении, Швейцарское агентство развития и сотрудничества, Европейский союз, Фонд Генриха Бёлля, Фонд OSF Think Tank, Academic Swiss Caucasus Net, Фонд партнерства Евразия, Национальный фонд за демократию и Норвежский Хельсинкский комитет.